Ecodev a entrepris un processus de décentralisation de ses activités dans les zones géographiques où elle dispose d'une expérience importante à savoir, dans le Brakna (Boghé, Bababé) et le Gorgol (Kaedi, Ganki, Etc). Aujourd'hui, deux antennes régionales sont opérationnelles à Boghé et à Kaédi. La création d'antennes au niveau des wilayas de l'intérieur est encouragées par la politique actuelle de décentralisation qui s'appuie sur les structures présentes localement, plus à même de comprendre les réalités locales et de valoriser les potentiels et les savoir-faire existants. Le siège central est basé à Nouakchott, couvre les actions entreprises par l’ONG dans ces zones d’intervention.